Если при проведении реакции пребывание среза в реактиве должно быть кратковременным, то ее можно проделывать непосредственно на предметном стекле. Если же срез должен быть выдержан в реактиве в течение длительного времени или надо сменять несколько реактивов и промывать срезы в воде, то лучше все эти манипуляции проделывать в часовых стеклах.
После проведения всех предварительных операций, если они имели место, срез помещают на чистое предметное стекло в каплю последнего по ходу реакции реактива. После этого срез накрывают покровным стеклом и получают временный препарат для изучения его под микроскопом.
Препараты, приготовленные из свежего материала, как правило, портятся вскоре после проведения реакции, и их нельзя сохранять. Некоторые реакции, проведенные на фиксированном материале, могут быть закреплены на постоянных препаратах, будь то срезы, сделанные от руки, микротомные срезы или раздавленные корешки или пыльники.