15.09.2017

Российские биологи собрали геном нефтеразлагающей бактерии

Геном — совокупность наследственного материала, заключенного в клетке организма. Геном содержит биологическую информацию, которая необходима для построения и поддержания организма.

Сотрудники НИИ физико-химической биологии имени А. Н. Белозерского МГУ имени М. В. Ломоносова собрали геном бактерии из Баренцева моря, которая разлагает нефть и другие загрязняющие окружающую среду соединения.

«Основным результатом работы является сборка бактериального генома нефтеразлагающей бактерии Thalassolituus oleivorans, штамм К-188. Эта бактерия была отобрана из поверхностных вод Баренцева моря. Штамм содержит гены, необходимые для утилизации сложных (длинноцепочечных) углеводородов», — рассказала одна из авторов статьи кандидат биологических наук Виктория Штратникова.

В ходе работы ученые использовали методы секвенирования нового поколения (NGS-секвенирования) и последующей биоинформатической сборки генома. Сотрудники МГУ проводили NGS-секвенирование, частично автоматическую и ручную часть обработки, а также проверку генома.

«Бактерия Thalassolituus oleivorans может использоваться для утилизации нефтяных углеводородов и очистки загрязненных вод. Секвенирование ее генома обеспечивает фундаментальный базис для исследования возможностей утилизации длинноцепочечных углеводородов в условиях северных морей, а также для биоинженерных и генетических манипуляций, позволяющих улучшить биотехнологические свойства штамма», — заключает Виктория Штратникова.

Работа проходила в сотрудничестве с учеными из Института микробиологии имени С. Н. Виноградского РАН, Института общей генетики имени Н. И. Вавилова РАН, Государственного научно-исследовательского института генетики и селекции промышленных микроорганизмов, Института проблем передачи информации имени А. А. Харкевича РАН и Московского физико-технического института.

Результаты исследования были опубликованы в журнале Marine Genomics.

Anna Medvedeva

Источники:

1. agroxxi.ru