Структурные и функциональные изменения, происходящие во время метаморфоза, подготавливают организм к взрослой жизни в новом местообитании. В некоторых случаях необходимые новые адаптации могут появляться в то время, когда организм еще не вышел из личиночной стадии и занимает личиночное местообитание. Иными словами, метаморфоз - это не просто реакция на изменение среды, а подготовка к ее изменению. Например, головастики, обитающие в воде, где им не грозит высыхание, выделяют примерно 80% азотистых продуктов обмена в виде аммиака. На более поздних стадиях метаморфоза, но все еще оставаясь в воде, головастики начинают выделять мочевину. А к тому времени, когда молодые лягушки готовы выйти из воды, они выделяют уже 80% азотистых отходов в виде мочевины.
Если на рост и дифференцировку гормоны могут оказывать влияние, то метаморфоз всецело контролируется и регулируется эндокринными факторами. В одних случаях метаморфоз представляет собой реакцию на повышение уровня гормонов, а в других - это результат различных реакций разных органов - мишеней на один и тот же уровень какого-то гормона. Эти реакции могут выражаться либо в гибели клеток и уменьшении размеров какого-либо органа (инволюция), либо в делении клеток, их дифференцировке и росте органа.