Известны две наиболее распространенные гистохимические реакции на нуклеиновые кислоты: реакция Фельгена с реактивом Шиффа на ДНК и реакция с метиловым зеленым - пиронином и рибонуклеазой по Браше на РНК и ДНК.
Обычно эти реакции проводятся на микротомных препаратах, изготовленных из фиксированного материала. Однако можно использовать и бритвенные срезы из материала, зафиксированного заранее или во время приготовления препаратов. В некоторых случаях можно использовать и свежий материал.